Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pan3Q640Q5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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