Protein–RNA interactions for Protein: Q640M6

Gdpd5, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd5Q640M6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gdpd5Q640M6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms