Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CochQ62507 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CochQ62507 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CochQ62507 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CochQ62507 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms