Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga3Q62470 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms