Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Six2Q62232 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six2Q62232 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms