Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sycp1Q62209 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms