Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Ttf1Q62187 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms