Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ssr4Q62186 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ssr4Q62186 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ssr4Q62186 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms