Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Npm1Q61937 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npm1Q61937 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms