Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Lcp1Q61233 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lcp1Q61233 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms