Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usf1Q61069 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms