Protein–RNA interactions for Protein: Q61035

Hars, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HarsQ61035 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HarsQ61035 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HarsQ61035 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HarsQ61035 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HarsQ61035 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HarsQ61035 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HarsQ61035 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HarsQ61035 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HarsQ61035 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms