Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Grik1Q60934 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Grik1Q60934 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Grik1Q60934 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Grik1Q60934 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Grik1Q60934 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Grik1Q60934 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Grik1Q60934 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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