Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Csnk2a1Q60737 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Csnk2a1Q60737 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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