Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tcf4Q60722 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tcf4Q60722 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms