Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ItgaeQ60677 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms