Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CttnQ60598 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CttnQ60598 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms