Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Tdrd5Q5VCS6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms