Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Trim38Q5SZ99 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim38Q5SZ99 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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