Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc42Q5SV66 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms