Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ankrd40Q5SUE8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms