Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc88aQ5SNZ0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc88aQ5SNZ0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms