Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarf1Q5ND28 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms