Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim41Q5NCC3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim41Q5NCC3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms