Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SynaQ5G5D5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SynaQ5G5D5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms