Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm3558Q5FWC9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm3558Q5FWC9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm3558Q5FWC9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm3558Q5FWC9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm3558Q5FWC9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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