Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prkaa1Q5EG47 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prkaa1Q5EG47 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms