Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srbd1Q497V5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srbd1Q497V5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms