Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Garnl3Q3V0G7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms