Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc9Q3V038 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms