Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hipk4Q3V016 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hipk4Q3V016 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms