Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc160Q3UYG1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc160Q3UYG1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc160Q3UYG1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc160Q3UYG1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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