Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX43

Ankrd13c, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd13cQ3UX43 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ankrd13cQ3UX43 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms