Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn13Q3UW68 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms