Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn4Q3UV66 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms