Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
BB287469Q3UT53 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms