Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfp560Q3URI6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms