Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sec31aQ3UPL0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms