Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
E330014E10RikQ3UL33 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
E330014E10RikQ3UL33 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.1 ms