Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

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Length 891 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fam35aQ3UEN2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fam35aQ3UEN2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms