Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip13Q3UA06 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms