Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gtpbp6Q3U6U5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 AC163038.1-201ENSMUST00000223632 1142 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gtpbp6Q3U6U5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms