Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Otud5Q3U2S4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Otud5Q3U2S4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms