Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc38a5Q3U1J0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc38a5Q3U1J0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms