Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc174Q3U155 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc174Q3U155 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms