Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Hace1Q3U0D9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hace1Q3U0D9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms