Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hhla1Q3TYV2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hhla1Q3TYV2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms