Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atp13a5Q3TYU2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms