Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
InipQ3TXT3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
InipQ3TXT3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms