Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q3TTJ4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q3TTJ4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms